Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrrc58Q3UGP9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc58Q3UGP9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc58Q3UGP9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc58Q3UGP9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc58Q3UGP9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc58Q3UGP9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc58Q3UGP9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc58Q3UGP9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc58Q3UGP9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc58Q3UGP9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc58Q3UGP9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc58Q3UGP9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc58Q3UGP9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrrc58Q3UGP9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc58Q3UGP9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc58Q3UGP9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc58Q3UGP9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc58Q3UGP9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc58Q3UGP9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc58Q3UGP9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc58Q3UGP9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc58Q3UGP9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc58Q3UGP9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc58Q3UGP9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc58Q3UGP9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc58Q3UGP9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc58Q3UGP9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc58Q3UGP9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc58Q3UGP9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc58Q3UGP9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms