Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsph3aQ3UFY4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rsph3aQ3UFY4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rsph3aQ3UFY4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsph3aQ3UFY4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rsph3aQ3UFY4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rsph3aQ3UFY4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rsph3aQ3UFY4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rsph3aQ3UFY4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Rsph3aQ3UFY4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rsph3aQ3UFY4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rsph3aQ3UFY4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rsph3aQ3UFY4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rsph3aQ3UFY4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsph3aQ3UFY4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsph3aQ3UFY4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsph3aQ3UFY4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsph3aQ3UFY4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rsph3aQ3UFY4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rsph3aQ3UFY4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rsph3aQ3UFY4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rsph3aQ3UFY4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rsph3aQ3UFY4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rsph3aQ3UFY4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rsph3aQ3UFY4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rsph3aQ3UFY4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsph3aQ3UFY4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsph3aQ3UFY4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rsph3aQ3UFY4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rsph3aQ3UFY4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rsph3aQ3UFY4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Rsph3aQ3UFY4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rsph3aQ3UFY4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rsph3aQ3UFY4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rsph3aQ3UFY4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rsph3aQ3UFY4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rsph3aQ3UFY4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rsph3aQ3UFY4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rsph3aQ3UFY4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rsph3aQ3UFY4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rsph3aQ3UFY4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rsph3aQ3UFY4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rsph3aQ3UFY4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rsph3aQ3UFY4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rsph3aQ3UFY4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rsph3aQ3UFY4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Rsph3aQ3UFY4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rsph3aQ3UFY4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rsph3aQ3UFY4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsph3aQ3UFY4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsph3aQ3UFY4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsph3aQ3UFY4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsph3aQ3UFY4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rsph3aQ3UFY4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Rsph3aQ3UFY4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rsph3aQ3UFY4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rsph3aQ3UFY4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rsph3aQ3UFY4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsph3aQ3UFY4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsph3aQ3UFY4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsph3aQ3UFY4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsph3aQ3UFY4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsph3aQ3UFY4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsph3aQ3UFY4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsph3aQ3UFY4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsph3aQ3UFY4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rsph3aQ3UFY4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rsph3aQ3UFY4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rsph3aQ3UFY4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rsph3aQ3UFY4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rsph3aQ3UFY4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rsph3aQ3UFY4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsph3aQ3UFY4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsph3aQ3UFY4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph3aQ3UFY4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsph3aQ3UFY4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsph3aQ3UFY4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsph3aQ3UFY4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsph3aQ3UFY4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsph3aQ3UFY4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsph3aQ3UFY4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph3aQ3UFY4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph3aQ3UFY4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph3aQ3UFY4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph3aQ3UFY4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph3aQ3UFY4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rsph3aQ3UFY4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsph3aQ3UFY4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph3aQ3UFY4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsph3aQ3UFY4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsph3aQ3UFY4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsph3aQ3UFY4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsph3aQ3UFY4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsph3aQ3UFY4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsph3aQ3UFY4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsph3aQ3UFY4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsph3aQ3UFY4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rsph3aQ3UFY4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms