Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Yipf3Q3UDR8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Yipf3Q3UDR8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Yipf3Q3UDR8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Yipf3Q3UDR8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Yipf3Q3UDR8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Yipf3Q3UDR8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Yipf3Q3UDR8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Yipf3Q3UDR8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Yipf3Q3UDR8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Yipf3Q3UDR8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Yipf3Q3UDR8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Yipf3Q3UDR8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Yipf3Q3UDR8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Yipf3Q3UDR8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Yipf3Q3UDR8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Yipf3Q3UDR8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Yipf3Q3UDR8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Yipf3Q3UDR8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Yipf3Q3UDR8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Yipf3Q3UDR8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Yipf3Q3UDR8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Yipf3Q3UDR8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Yipf3Q3UDR8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Yipf3Q3UDR8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Yipf3Q3UDR8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Yipf3Q3UDR8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Yipf3Q3UDR8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Yipf3Q3UDR8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Yipf3Q3UDR8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Yipf3Q3UDR8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Yipf3Q3UDR8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Yipf3Q3UDR8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Yipf3Q3UDR8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Yipf3Q3UDR8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Yipf3Q3UDR8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Yipf3Q3UDR8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Yipf3Q3UDR8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Yipf3Q3UDR8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Yipf3Q3UDR8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Yipf3Q3UDR8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Yipf3Q3UDR8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Yipf3Q3UDR8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Yipf3Q3UDR8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Yipf3Q3UDR8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Yipf3Q3UDR8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Yipf3Q3UDR8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Yipf3Q3UDR8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Yipf3Q3UDR8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Yipf3Q3UDR8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Yipf3Q3UDR8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Yipf3Q3UDR8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Yipf3Q3UDR8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Yipf3Q3UDR8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Yipf3Q3UDR8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms