Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ulk3Q3U3Q1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ulk3Q3U3Q1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ulk3Q3U3Q1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Ulk3Q3U3Q1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Ulk3Q3U3Q1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Ulk3Q3U3Q1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,36
Ulk3Q3U3Q1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Ulk3Q3U3Q1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Ulk3Q3U3Q1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Ulk3Q3U3Q1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Ulk3Q3U3Q1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Ulk3Q3U3Q1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ulk3Q3U3Q1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ulk3Q3U3Q1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ulk3Q3U3Q1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ulk3Q3U3Q1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Ulk3Q3U3Q1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Ulk3Q3U3Q1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Ulk3Q3U3Q1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Ulk3Q3U3Q1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Ulk3Q3U3Q1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Ulk3Q3U3Q1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Ulk3Q3U3Q1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ulk3Q3U3Q1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ulk3Q3U3Q1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ulk3Q3U3Q1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23,48■■□□□ 1,35
Ulk3Q3U3Q1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ulk3Q3U3Q1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ulk3Q3U3Q1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ulk3Q3U3Q1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ulk3Q3U3Q1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Ulk3Q3U3Q1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Ulk3Q3U3Q1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Ulk3Q3U3Q1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ulk3Q3U3Q1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ulk3Q3U3Q1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ulk3Q3U3Q1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ulk3Q3U3Q1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ulk3Q3U3Q1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ulk3Q3U3Q1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ulk3Q3U3Q1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23,39■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ulk3Q3U3Q1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Ulk3Q3U3Q1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23,25■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23,24■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23,24■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ulk3Q3U3Q1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms