Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fam117bQ3U3E2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam117bQ3U3E2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam117bQ3U3E2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam117bQ3U3E2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam117bQ3U3E2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam117bQ3U3E2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam117bQ3U3E2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam117bQ3U3E2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam117bQ3U3E2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam117bQ3U3E2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam117bQ3U3E2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam117bQ3U3E2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam117bQ3U3E2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam117bQ3U3E2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam117bQ3U3E2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam117bQ3U3E2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam117bQ3U3E2 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam117bQ3U3E2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam117bQ3U3E2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam117bQ3U3E2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam117bQ3U3E2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam117bQ3U3E2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam117bQ3U3E2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam117bQ3U3E2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam117bQ3U3E2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam117bQ3U3E2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam117bQ3U3E2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam117bQ3U3E2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam117bQ3U3E2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam117bQ3U3E2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam117bQ3U3E2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam117bQ3U3E2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam117bQ3U3E2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam117bQ3U3E2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam117bQ3U3E2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam117bQ3U3E2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam117bQ3U3E2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam117bQ3U3E2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam117bQ3U3E2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam117bQ3U3E2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam117bQ3U3E2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam117bQ3U3E2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam117bQ3U3E2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam117bQ3U3E2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam117bQ3U3E2 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam117bQ3U3E2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam117bQ3U3E2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam117bQ3U3E2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam117bQ3U3E2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam117bQ3U3E2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms