Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdpgp1Q3TLS3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdpgp1Q3TLS3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdpgp1Q3TLS3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdpgp1Q3TLS3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdpgp1Q3TLS3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdpgp1Q3TLS3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdpgp1Q3TLS3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdpgp1Q3TLS3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdpgp1Q3TLS3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdpgp1Q3TLS3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdpgp1Q3TLS3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdpgp1Q3TLS3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdpgp1Q3TLS3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdpgp1Q3TLS3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdpgp1Q3TLS3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdpgp1Q3TLS3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdpgp1Q3TLS3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpgp1Q3TLS3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpgp1Q3TLS3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpgp1Q3TLS3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpgp1Q3TLS3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdpgp1Q3TLS3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdpgp1Q3TLS3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdpgp1Q3TLS3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpgp1Q3TLS3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpgp1Q3TLS3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpgp1Q3TLS3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpgp1Q3TLS3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdpgp1Q3TLS3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdpgp1Q3TLS3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdpgp1Q3TLS3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdpgp1Q3TLS3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdpgp1Q3TLS3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdpgp1Q3TLS3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdpgp1Q3TLS3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdpgp1Q3TLS3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdpgp1Q3TLS3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdpgp1Q3TLS3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpgp1Q3TLS3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpgp1Q3TLS3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gdpgp1Q3TLS3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdpgp1Q3TLS3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdpgp1Q3TLS3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpgp1Q3TLS3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpgp1Q3TLS3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpgp1Q3TLS3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdpgp1Q3TLS3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdpgp1Q3TLS3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdpgp1Q3TLS3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdpgp1Q3TLS3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdpgp1Q3TLS3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdpgp1Q3TLS3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpgp1Q3TLS3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdpgp1Q3TLS3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdpgp1Q3TLS3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdpgp1Q3TLS3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms