Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hp1bp3Q3TEA8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hp1bp3Q3TEA8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hp1bp3Q3TEA8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hp1bp3Q3TEA8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hp1bp3Q3TEA8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hp1bp3Q3TEA8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hp1bp3Q3TEA8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hp1bp3Q3TEA8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hp1bp3Q3TEA8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hp1bp3Q3TEA8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hp1bp3Q3TEA8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hp1bp3Q3TEA8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hp1bp3Q3TEA8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hp1bp3Q3TEA8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hp1bp3Q3TEA8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hp1bp3Q3TEA8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hp1bp3Q3TEA8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hp1bp3Q3TEA8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hp1bp3Q3TEA8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hp1bp3Q3TEA8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hp1bp3Q3TEA8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hp1bp3Q3TEA8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hp1bp3Q3TEA8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hp1bp3Q3TEA8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hp1bp3Q3TEA8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hp1bp3Q3TEA8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hp1bp3Q3TEA8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hp1bp3Q3TEA8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hp1bp3Q3TEA8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms