Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Pi4k2aQ2TBE6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pi4k2aQ2TBE6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pi4k2aQ2TBE6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pi4k2aQ2TBE6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pi4k2aQ2TBE6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pi4k2aQ2TBE6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pi4k2aQ2TBE6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pi4k2aQ2TBE6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pi4k2aQ2TBE6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pi4k2aQ2TBE6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pi4k2aQ2TBE6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pi4k2aQ2TBE6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pi4k2aQ2TBE6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pi4k2aQ2TBE6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pi4k2aQ2TBE6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pi4k2aQ2TBE6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pi4k2aQ2TBE6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pi4k2aQ2TBE6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pi4k2aQ2TBE6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pi4k2aQ2TBE6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pi4k2aQ2TBE6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pi4k2aQ2TBE6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pi4k2aQ2TBE6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pi4k2aQ2TBE6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pi4k2aQ2TBE6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pi4k2aQ2TBE6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pi4k2aQ2TBE6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pi4k2aQ2TBE6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pi4k2aQ2TBE6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pi4k2aQ2TBE6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pi4k2aQ2TBE6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pi4k2aQ2TBE6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pi4k2aQ2TBE6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Pi4k2aQ2TBE6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pi4k2aQ2TBE6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pi4k2aQ2TBE6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pi4k2aQ2TBE6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pi4k2aQ2TBE6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pi4k2aQ2TBE6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pi4k2aQ2TBE6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pi4k2aQ2TBE6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pi4k2aQ2TBE6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pi4k2aQ2TBE6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pi4k2aQ2TBE6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pi4k2aQ2TBE6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pi4k2aQ2TBE6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pi4k2aQ2TBE6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pi4k2aQ2TBE6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pi4k2aQ2TBE6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms