Protein–RNA interactions for Protein: Q14B70

Hdx, Highly divergent homeobox, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdxQ14B70 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HdxQ14B70 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HdxQ14B70 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HdxQ14B70 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HdxQ14B70 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HdxQ14B70 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HdxQ14B70 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HdxQ14B70 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HdxQ14B70 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HdxQ14B70 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HdxQ14B70 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HdxQ14B70 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HdxQ14B70 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HdxQ14B70 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HdxQ14B70 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HdxQ14B70 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HdxQ14B70 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HdxQ14B70 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HdxQ14B70 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HdxQ14B70 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HdxQ14B70 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HdxQ14B70 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HdxQ14B70 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HdxQ14B70 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HdxQ14B70 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HdxQ14B70 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HdxQ14B70 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HdxQ14B70 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HdxQ14B70 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HdxQ14B70 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HdxQ14B70 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HdxQ14B70 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HdxQ14B70 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HdxQ14B70 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HdxQ14B70 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HdxQ14B70 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HdxQ14B70 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HdxQ14B70 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HdxQ14B70 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HdxQ14B70 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HdxQ14B70 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HdxQ14B70 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HdxQ14B70 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HdxQ14B70 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HdxQ14B70 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdxQ14B70 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HdxQ14B70 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdxQ14B70 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdxQ14B70 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HdxQ14B70 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HdxQ14B70 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HdxQ14B70 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HdxQ14B70 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdxQ14B70 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdxQ14B70 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HdxQ14B70 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdxQ14B70 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdxQ14B70 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HdxQ14B70 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HdxQ14B70 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HdxQ14B70 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HdxQ14B70 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdxQ14B70 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdxQ14B70 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdxQ14B70 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdxQ14B70 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms