Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
VgfQ0VGU4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
VgfQ0VGU4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
VgfQ0VGU4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
VgfQ0VGU4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
VgfQ0VGU4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
VgfQ0VGU4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
VgfQ0VGU4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
VgfQ0VGU4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
VgfQ0VGU4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VgfQ0VGU4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VgfQ0VGU4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VgfQ0VGU4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
VgfQ0VGU4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
VgfQ0VGU4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
VgfQ0VGU4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
VgfQ0VGU4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
VgfQ0VGU4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
VgfQ0VGU4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
VgfQ0VGU4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
VgfQ0VGU4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
VgfQ0VGU4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
VgfQ0VGU4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
VgfQ0VGU4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
VgfQ0VGU4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
VgfQ0VGU4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
VgfQ0VGU4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
VgfQ0VGU4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
VgfQ0VGU4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
VgfQ0VGU4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
VgfQ0VGU4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
VgfQ0VGU4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
VgfQ0VGU4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
VgfQ0VGU4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VgfQ0VGU4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
VgfQ0VGU4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
VgfQ0VGU4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
VgfQ0VGU4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
VgfQ0VGU4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
VgfQ0VGU4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
VgfQ0VGU4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
VgfQ0VGU4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
VgfQ0VGU4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
VgfQ0VGU4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
VgfQ0VGU4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
VgfQ0VGU4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
VgfQ0VGU4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
VgfQ0VGU4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
VgfQ0VGU4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
VgfQ0VGU4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
VgfQ0VGU4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
VgfQ0VGU4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
VgfQ0VGU4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
VgfQ0VGU4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
VgfQ0VGU4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
VgfQ0VGU4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
VgfQ0VGU4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
VgfQ0VGU4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VgfQ0VGU4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VgfQ0VGU4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VgfQ0VGU4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
VgfQ0VGU4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
VgfQ0VGU4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
VgfQ0VGU4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
VgfQ0VGU4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
VgfQ0VGU4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
VgfQ0VGU4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
VgfQ0VGU4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
VgfQ0VGU4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
VgfQ0VGU4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
VgfQ0VGU4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
VgfQ0VGU4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
VgfQ0VGU4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
VgfQ0VGU4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
VgfQ0VGU4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
VgfQ0VGU4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
VgfQ0VGU4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
VgfQ0VGU4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
VgfQ0VGU4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
VgfQ0VGU4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
VgfQ0VGU4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
VgfQ0VGU4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
VgfQ0VGU4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
VgfQ0VGU4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VgfQ0VGU4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VgfQ0VGU4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
VgfQ0VGU4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
VgfQ0VGU4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
VgfQ0VGU4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
VgfQ0VGU4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
VgfQ0VGU4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
VgfQ0VGU4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
VgfQ0VGU4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
VgfQ0VGU4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VgfQ0VGU4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
VgfQ0VGU4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VgfQ0VGU4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
VgfQ0VGU4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
VgfQ0VGU4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
VgfQ0VGU4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms