Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc39dQ0VF76 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc39dQ0VF76 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc39dQ0VF76 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc39dQ0VF76 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc39dQ0VF76 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttc39dQ0VF76 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttc39dQ0VF76 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc39dQ0VF76 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc39dQ0VF76 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttc39dQ0VF76 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc39dQ0VF76 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc39dQ0VF76 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc39dQ0VF76 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc39dQ0VF76 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ttc39dQ0VF76 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms