Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tigd2Q0VBL1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tigd2Q0VBL1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tigd2Q0VBL1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tigd2Q0VBL1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tigd2Q0VBL1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tigd2Q0VBL1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tigd2Q0VBL1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tigd2Q0VBL1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tigd2Q0VBL1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tigd2Q0VBL1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tigd2Q0VBL1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tigd2Q0VBL1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tigd2Q0VBL1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tigd2Q0VBL1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd2Q0VBL1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd2Q0VBL1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd2Q0VBL1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd2Q0VBL1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tigd2Q0VBL1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tigd2Q0VBL1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tigd2Q0VBL1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tigd2Q0VBL1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tigd2Q0VBL1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tigd2Q0VBL1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tigd2Q0VBL1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tigd2Q0VBL1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tigd2Q0VBL1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tigd2Q0VBL1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tigd2Q0VBL1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tigd2Q0VBL1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tigd2Q0VBL1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tigd2Q0VBL1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tigd2Q0VBL1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tigd2Q0VBL1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tigd2Q0VBL1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tigd2Q0VBL1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tigd2Q0VBL1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tigd2Q0VBL1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tigd2Q0VBL1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tigd2Q0VBL1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tigd2Q0VBL1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tigd2Q0VBL1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tigd2Q0VBL1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tigd2Q0VBL1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tigd2Q0VBL1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tigd2Q0VBL1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms