Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Znf541Q0GGX2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Znf541Q0GGX2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Znf541Q0GGX2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Znf541Q0GGX2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Znf541Q0GGX2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Znf541Q0GGX2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Znf541Q0GGX2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Znf541Q0GGX2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Znf541Q0GGX2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
Znf541Q0GGX2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Znf541Q0GGX2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Znf541Q0GGX2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Znf541Q0GGX2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Znf541Q0GGX2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Znf541Q0GGX2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Znf541Q0GGX2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Znf541Q0GGX2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Znf541Q0GGX2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Znf541Q0GGX2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Znf541Q0GGX2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Znf541Q0GGX2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Znf541Q0GGX2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Znf541Q0GGX2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Znf541Q0GGX2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Znf541Q0GGX2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Znf541Q0GGX2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Znf541Q0GGX2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Znf541Q0GGX2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Znf541Q0GGX2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Znf541Q0GGX2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Znf541Q0GGX2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Znf541Q0GGX2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Znf541Q0GGX2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Znf541Q0GGX2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Znf541Q0GGX2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Znf541Q0GGX2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Znf541Q0GGX2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Znf541Q0GGX2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Znf541Q0GGX2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Znf541Q0GGX2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Znf541Q0GGX2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Znf541Q0GGX2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Znf541Q0GGX2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Znf541Q0GGX2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Znf541Q0GGX2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Znf541Q0GGX2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Znf541Q0GGX2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Znf541Q0GGX2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Znf541Q0GGX2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Znf541Q0GGX2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Znf541Q0GGX2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Znf541Q0GGX2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Znf541Q0GGX2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Znf541Q0GGX2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Znf541Q0GGX2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Znf541Q0GGX2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Znf541Q0GGX2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Znf541Q0GGX2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Znf541Q0GGX2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Znf541Q0GGX2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Znf541Q0GGX2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Znf541Q0GGX2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Znf541Q0GGX2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Znf541Q0GGX2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Znf541Q0GGX2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Znf541Q0GGX2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Znf541Q0GGX2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Znf541Q0GGX2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Znf541Q0GGX2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Znf541Q0GGX2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Znf541Q0GGX2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Znf541Q0GGX2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Znf541Q0GGX2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Znf541Q0GGX2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Znf541Q0GGX2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Znf541Q0GGX2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Znf541Q0GGX2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Znf541Q0GGX2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Znf541Q0GGX2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Znf541Q0GGX2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Znf541Q0GGX2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Znf541Q0GGX2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Znf541Q0GGX2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Znf541Q0GGX2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Znf541Q0GGX2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Znf541Q0GGX2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Znf541Q0GGX2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Znf541Q0GGX2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms