Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc7a1Q09143 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc7a1Q09143 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc7a1Q09143 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc7a1Q09143 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc7a1Q09143 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc7a1Q09143 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc7a1Q09143 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc7a1Q09143 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Slc7a1Q09143 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc7a1Q09143 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc7a1Q09143 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc7a1Q09143 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc7a1Q09143 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc7a1Q09143 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc7a1Q09143 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc7a1Q09143 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc7a1Q09143 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc7a1Q09143 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc7a1Q09143 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc7a1Q09143 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc7a1Q09143 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc7a1Q09143 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc7a1Q09143 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc7a1Q09143 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc7a1Q09143 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Slc7a1Q09143 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slc7a1Q09143 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc7a1Q09143 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc7a1Q09143 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slc7a1Q09143 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slc7a1Q09143 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slc7a1Q09143 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slc7a1Q09143 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc7a1Q09143 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc7a1Q09143 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc7a1Q09143 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc7a1Q09143 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc7a1Q09143 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc7a1Q09143 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc7a1Q09143 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc7a1Q09143 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc7a1Q09143 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc7a1Q09143 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc7a1Q09143 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc7a1Q09143 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc7a1Q09143 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc7a1Q09143 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc7a1Q09143 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc7a1Q09143 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc7a1Q09143 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc7a1Q09143 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc7a1Q09143 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc7a1Q09143 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slc7a1Q09143 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc7a1Q09143 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc7a1Q09143 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc7a1Q09143 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc7a1Q09143 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc7a1Q09143 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc7a1Q09143 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc7a1Q09143 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc7a1Q09143 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc7a1Q09143 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc7a1Q09143 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc7a1Q09143 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc7a1Q09143 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc7a1Q09143 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc7a1Q09143 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc7a1Q09143 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc7a1Q09143 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc7a1Q09143 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc7a1Q09143 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc7a1Q09143 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc7a1Q09143 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc7a1Q09143 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc7a1Q09143 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc7a1Q09143 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc7a1Q09143 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc7a1Q09143 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc7a1Q09143 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc7a1Q09143 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc7a1Q09143 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc7a1Q09143 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms