Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MitfQ08874 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MitfQ08874 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MitfQ08874 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MitfQ08874 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MitfQ08874 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MitfQ08874 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MitfQ08874 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MitfQ08874 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MitfQ08874 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MitfQ08874 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MitfQ08874 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MitfQ08874 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MitfQ08874 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MitfQ08874 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MitfQ08874 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MitfQ08874 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MitfQ08874 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MitfQ08874 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MitfQ08874 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MitfQ08874 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MitfQ08874 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MitfQ08874 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MitfQ08874 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MitfQ08874 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MitfQ08874 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MitfQ08874 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MitfQ08874 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MitfQ08874 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MitfQ08874 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MitfQ08874 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MitfQ08874 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MitfQ08874 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MitfQ08874 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MitfQ08874 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MitfQ08874 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MitfQ08874 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MitfQ08874 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MitfQ08874 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MitfQ08874 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MitfQ08874 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MitfQ08874 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MitfQ08874 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MitfQ08874 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MitfQ08874 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MitfQ08874 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MitfQ08874 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MitfQ08874 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MitfQ08874 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MitfQ08874 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MitfQ08874 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MitfQ08874 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MitfQ08874 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MitfQ08874 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MitfQ08874 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MitfQ08874 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MitfQ08874 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MitfQ08874 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MitfQ08874 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MitfQ08874 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MitfQ08874 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MitfQ08874 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MitfQ08874 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MitfQ08874 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MitfQ08874 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MitfQ08874 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MitfQ08874 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MitfQ08874 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MitfQ08874 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MitfQ08874 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MitfQ08874 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MitfQ08874 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MitfQ08874 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MitfQ08874 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MitfQ08874 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MitfQ08874 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MitfQ08874 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MitfQ08874 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MitfQ08874 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MitfQ08874 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MitfQ08874 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MitfQ08874 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MitfQ08874 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MitfQ08874 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MitfQ08874 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms