Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gata4Q08369 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Gata4Q08369 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata4Q08369 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gata4Q08369 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gata4Q08369 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gata4Q08369 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gata4Q08369 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gata4Q08369 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gata4Q08369 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms