Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calb2Q08331 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calb2Q08331 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calb2Q08331 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calb2Q08331 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calb2Q08331 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calb2Q08331 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calb2Q08331 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calb2Q08331 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calb2Q08331 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calb2Q08331 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calb2Q08331 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calb2Q08331 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calb2Q08331 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calb2Q08331 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calb2Q08331 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calb2Q08331 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calb2Q08331 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calb2Q08331 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calb2Q08331 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calb2Q08331 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calb2Q08331 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calb2Q08331 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calb2Q08331 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calb2Q08331 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Calb2Q08331 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calb2Q08331 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calb2Q08331 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calb2Q08331 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calb2Q08331 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calb2Q08331 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calb2Q08331 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calb2Q08331 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calb2Q08331 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Calb2Q08331 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calb2Q08331 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calb2Q08331 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calb2Q08331 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calb2Q08331 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Calb2Q08331 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calb2Q08331 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calb2Q08331 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calb2Q08331 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calb2Q08331 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calb2Q08331 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calb2Q08331 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calb2Q08331 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calb2Q08331 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calb2Q08331 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calb2Q08331 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calb2Q08331 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calb2Q08331 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calb2Q08331 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calb2Q08331 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calb2Q08331 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calb2Q08331 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calb2Q08331 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calb2Q08331 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Calb2Q08331 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calb2Q08331 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calb2Q08331 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calb2Q08331 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calb2Q08331 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calb2Q08331 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calb2Q08331 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Calb2Q08331 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calb2Q08331 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calb2Q08331 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calb2Q08331 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calb2Q08331 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calb2Q08331 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calb2Q08331 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Calb2Q08331 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calb2Q08331 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calb2Q08331 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calb2Q08331 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calb2Q08331 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calb2Q08331 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calb2Q08331 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Calb2Q08331 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calb2Q08331 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calb2Q08331 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Calb2Q08331 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Calb2Q08331 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calb2Q08331 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Calb2Q08331 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Calb2Q08331 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calb2Q08331 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calb2Q08331 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calb2Q08331 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calb2Q08331 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calb2Q08331 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calb2Q08331 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calb2Q08331 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Calb2Q08331 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Calb2Q08331 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms