Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad51Q08297 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad51Q08297 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad51Q08297 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad51Q08297 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad51Q08297 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rad51Q08297 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad51Q08297 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad51Q08297 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad51Q08297 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad51Q08297 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad51Q08297 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad51Q08297 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad51Q08297 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad51Q08297 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad51Q08297 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad51Q08297 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad51Q08297 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad51Q08297 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad51Q08297 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad51Q08297 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad51Q08297 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad51Q08297 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rad51Q08297 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad51Q08297 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad51Q08297 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad51Q08297 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad51Q08297 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad51Q08297 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad51Q08297 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad51Q08297 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad51Q08297 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rad51Q08297 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad51Q08297 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad51Q08297 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad51Q08297 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad51Q08297 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad51Q08297 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad51Q08297 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad51Q08297 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad51Q08297 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad51Q08297 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad51Q08297 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad51Q08297 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad51Q08297 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad51Q08297 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad51Q08297 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad51Q08297 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad51Q08297 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad51Q08297 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad51Q08297 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad51Q08297 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad51Q08297 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms