Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah2Q06986 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah2Q06986 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah2Q06986 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah2Q06986 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah2Q06986 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah2Q06986 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah2Q06986 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah2Q06986 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah2Q06986 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah2Q06986 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah2Q06986 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah2Q06986 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah2Q06986 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah2Q06986 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah2Q06986 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Siah2Q06986 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah2Q06986 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah2Q06986 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah2Q06986 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah2Q06986 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah2Q06986 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah2Q06986 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah2Q06986 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah2Q06986 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah2Q06986 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah2Q06986 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah2Q06986 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah2Q06986 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah2Q06986 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah2Q06986 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah2Q06986 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah2Q06986 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah2Q06986 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah2Q06986 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Siah2Q06986 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah2Q06986 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah2Q06986 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Siah2Q06986 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Siah2Q06986 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Siah2Q06986 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Siah2Q06986 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Siah2Q06986 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Siah2Q06986 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Siah2Q06986 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms