Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrx2Q06348 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrx2Q06348 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrx2Q06348 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrx2Q06348 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrx2Q06348 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrx2Q06348 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrx2Q06348 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrx2Q06348 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrx2Q06348 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrx2Q06348 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrx2Q06348 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrx2Q06348 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrx2Q06348 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrx2Q06348 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrx2Q06348 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrx2Q06348 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrx2Q06348 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrx2Q06348 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrx2Q06348 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrx2Q06348 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrx2Q06348 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrx2Q06348 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrx2Q06348 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prrx2Q06348 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrx2Q06348 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrx2Q06348 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrx2Q06348 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrx2Q06348 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrx2Q06348 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrx2Q06348 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrx2Q06348 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrx2Q06348 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrx2Q06348 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrx2Q06348 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrx2Q06348 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrx2Q06348 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrx2Q06348 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrx2Q06348 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrx2Q06348 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrx2Q06348 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrx2Q06348 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrx2Q06348 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrx2Q06348 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrx2Q06348 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrx2Q06348 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrx2Q06348 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrx2Q06348 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrx2Q06348 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrx2Q06348 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms