Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sdr16c6Q05A13 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sdr16c6Q05A13 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sdr16c6Q05A13 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sdr16c6Q05A13 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sdr16c6Q05A13 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sdr16c6Q05A13 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sdr16c6Q05A13 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sdr16c6Q05A13 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sdr16c6Q05A13 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sdr16c6Q05A13 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sdr16c6Q05A13 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sdr16c6Q05A13 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sdr16c6Q05A13 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sdr16c6Q05A13 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sdr16c6Q05A13 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sdr16c6Q05A13 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sdr16c6Q05A13 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sdr16c6Q05A13 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sdr16c6Q05A13 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sdr16c6Q05A13 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sdr16c6Q05A13 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sdr16c6Q05A13 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sdr16c6Q05A13 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sdr16c6Q05A13 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sdr16c6Q05A13 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sdr16c6Q05A13 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sdr16c6Q05A13 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sdr16c6Q05A13 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sdr16c6Q05A13 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sdr16c6Q05A13 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sdr16c6Q05A13 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sdr16c6Q05A13 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sdr16c6Q05A13 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sdr16c6Q05A13 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sdr16c6Q05A13 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sdr16c6Q05A13 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sdr16c6Q05A13 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sdr16c6Q05A13 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sdr16c6Q05A13 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sdr16c6Q05A13 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sdr16c6Q05A13 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sdr16c6Q05A13 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sdr16c6Q05A13 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sdr16c6Q05A13 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sdr16c6Q05A13 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sdr16c6Q05A13 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sdr16c6Q05A13 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sdr16c6Q05A13 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sdr16c6Q05A13 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sdr16c6Q05A13 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sdr16c6Q05A13 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sdr16c6Q05A13 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sdr16c6Q05A13 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sdr16c6Q05A13 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sdr16c6Q05A13 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sdr16c6Q05A13 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sdr16c6Q05A13 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sdr16c6Q05A13 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sdr16c6Q05A13 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sdr16c6Q05A13 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sdr16c6Q05A13 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sdr16c6Q05A13 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sdr16c6Q05A13 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sdr16c6Q05A13 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sdr16c6Q05A13 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sdr16c6Q05A13 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sdr16c6Q05A13 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sdr16c6Q05A13 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sdr16c6Q05A13 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdr16c6Q05A13 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdr16c6Q05A13 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdr16c6Q05A13 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sdr16c6Q05A13 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sdr16c6Q05A13 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sdr16c6Q05A13 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sdr16c6Q05A13 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sdr16c6Q05A13 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sdr16c6Q05A13 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sdr16c6Q05A13 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sdr16c6Q05A13 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sdr16c6Q05A13 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms