Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RelbQ04863 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RelbQ04863 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RelbQ04863 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RelbQ04863 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RelbQ04863 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RelbQ04863 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RelbQ04863 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RelbQ04863 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RelbQ04863 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RelbQ04863 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RelbQ04863 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RelbQ04863 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RelbQ04863 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RelbQ04863 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RelbQ04863 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RelbQ04863 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RelbQ04863 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RelbQ04863 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RelbQ04863 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RelbQ04863 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RelbQ04863 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RelbQ04863 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RelbQ04863 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RelbQ04863 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RelbQ04863 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RelbQ04863 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RelbQ04863 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RelbQ04863 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RelbQ04863 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RelbQ04863 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RelbQ04863 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RelbQ04863 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RelbQ04863 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RelbQ04863 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RelbQ04863 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RelbQ04863 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RelbQ04863 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RelbQ04863 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RelbQ04863 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RelbQ04863 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RelbQ04863 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RelbQ04863 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RelbQ04863 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RelbQ04863 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RelbQ04863 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RelbQ04863 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RelbQ04863 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RelbQ04863 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms