Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nf1Q04690 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nf1Q04690 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nf1Q04690 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nf1Q04690 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nf1Q04690 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nf1Q04690 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nf1Q04690 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nf1Q04690 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nf1Q04690 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nf1Q04690 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nf1Q04690 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nf1Q04690 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nf1Q04690 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nf1Q04690 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nf1Q04690 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nf1Q04690 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nf1Q04690 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nf1Q04690 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nf1Q04690 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nf1Q04690 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nf1Q04690 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nf1Q04690 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nf1Q04690 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nf1Q04690 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nf1Q04690 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nf1Q04690 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nf1Q04690 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nf1Q04690 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nf1Q04690 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nf1Q04690 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nf1Q04690 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nf1Q04690 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nf1Q04690 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nf1Q04690 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nf1Q04690 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nf1Q04690 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nf1Q04690 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nf1Q04690 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nf1Q04690 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nf1Q04690 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nf1Q04690 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nf1Q04690 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nf1Q04690 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nf1Q04690 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nf1Q04690 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nf1Q04690 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nf1Q04690 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nf1Q04690 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nf1Q04690 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nf1Q04690 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nf1Q04690 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nf1Q04690 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nf1Q04690 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nf1Q04690 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nf1Q04690 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nf1Q04690 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nf1Q04690 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nf1Q04690 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms