Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Cacna1sQ02789 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Cacna1sQ02789 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,29■■■□□ 2,92
Cacna1sQ02789 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Cacna1sQ02789 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Cacna1sQ02789 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Cacna1sQ02789 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Cacna1sQ02789 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Cacna1sQ02789 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Cacna1sQ02789 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Cacna1sQ02789 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Cacna1sQ02789 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,2■■■□□ 2,91
Cacna1sQ02789 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33,2■■■□□ 2,91
Cacna1sQ02789 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,9
Cacna1sQ02789 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Cacna1sQ02789 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Cacna1sQ02789 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Cacna1sQ02789 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Cacna1sQ02789 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Cacna1sQ02789 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Cacna1sQ02789 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Cacna1sQ02789 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Cacna1sQ02789 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Cacna1sQ02789 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Cacna1sQ02789 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Cacna1sQ02789 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Cacna1sQ02789 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33,07■■■□□ 2,89
Cacna1sQ02789 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Cacna1sQ02789 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Cacna1sQ02789 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Cacna1sQ02789 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Cacna1sQ02789 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Cacna1sQ02789 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Cacna1sQ02789 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Cacna1sQ02789 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Cacna1sQ02789 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33,03■■■□□ 2,88
Cacna1sQ02789 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Cacna1sQ02789 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Cacna1sQ02789 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Cacna1sQ02789 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Cacna1sQ02789 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Cacna1sQ02789 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32,99■■■□□ 2,87
Cacna1sQ02789 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Cacna1sQ02789 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Cacna1sQ02789 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Cacna1sQ02789 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Cacna1sQ02789 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Cacna1sQ02789 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,97■■■□□ 2,87
Cacna1sQ02789 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Cacna1sQ02789 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Cacna1sQ02789 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Cacna1sQ02789 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Cacna1sQ02789 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Cacna1sQ02789 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Cacna1sQ02789 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32,91■■■□□ 2,86
Cacna1sQ02789 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Cacna1sQ02789 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Cacna1sQ02789 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Cacna1sQ02789 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Cacna1sQ02789 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Cacna1sQ02789 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Cacna1sQ02789 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Cacna1sQ02789 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Cacna1sQ02789 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32,86■■■□□ 2,85
Cacna1sQ02789 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Cacna1sQ02789 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Cacna1sQ02789 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Cacna1sQ02789 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32,84■■■□□ 2,85
Cacna1sQ02789 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Cacna1sQ02789 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32,82■■■□□ 2,85
Cacna1sQ02789 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32,82■■■□□ 2,84
Cacna1sQ02789 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Cacna1sQ02789 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Cacna1sQ02789 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Cacna1sQ02789 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Cacna1sQ02789 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Cacna1sQ02789 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,84
Cacna1sQ02789 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,84
Cacna1sQ02789 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32,76■■■□□ 2,83
Cacna1sQ02789 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32,76■■■□□ 2,83
Cacna1sQ02789 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Cacna1sQ02789 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Cacna1sQ02789 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32,75■■■□□ 2,83
Cacna1sQ02789 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Cacna1sQ02789 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32,73■■■□□ 2,83
Cacna1sQ02789 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Cacna1sQ02789 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Cacna1sQ02789 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC32,68■■■□□ 2,82
Cacna1sQ02789 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Cacna1sQ02789 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Cacna1sQ02789 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Cacna1sQ02789 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Cacna1sQ02789 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,62■■■□□ 2,81
Cacna1sQ02789 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC32,62■■■□□ 2,81
Cacna1sQ02789 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Cacna1sQ02789 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Cacna1sQ02789 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Cacna1sQ02789 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Cacna1sQ02789 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,6■■■□□ 2,81
Cacna1sQ02789 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,7 ms