Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GscQ02591 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GscQ02591 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GscQ02591 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GscQ02591 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GscQ02591 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GscQ02591 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GscQ02591 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GscQ02591 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GscQ02591 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GscQ02591 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GscQ02591 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GscQ02591 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GscQ02591 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GscQ02591 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GscQ02591 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GscQ02591 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GscQ02591 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GscQ02591 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GscQ02591 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GscQ02591 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GscQ02591 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GscQ02591 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GscQ02591 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GscQ02591 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GscQ02591 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GscQ02591 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GscQ02591 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GscQ02591 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GscQ02591 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GscQ02591 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GscQ02591 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GscQ02591 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GscQ02591 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GscQ02591 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GscQ02591 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GscQ02591 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GscQ02591 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GscQ02591 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GscQ02591 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GscQ02591 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GscQ02591 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GscQ02591 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GscQ02591 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GscQ02591 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GscQ02591 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GscQ02591 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GscQ02591 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GscQ02591 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GscQ02591 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GscQ02591 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GscQ02591 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GscQ02591 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GscQ02591 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GscQ02591 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GscQ02591 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GscQ02591 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GscQ02591 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GscQ02591 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GscQ02591 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GscQ02591 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GscQ02591 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GscQ02591 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GscQ02591 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GscQ02591 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GscQ02591 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GscQ02591 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GscQ02591 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GscQ02591 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GscQ02591 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GscQ02591 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GscQ02591 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GscQ02591 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GscQ02591 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GscQ02591 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GscQ02591 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GscQ02591 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GscQ02591 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GscQ02591 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GscQ02591 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GscQ02591 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GscQ02591 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GscQ02591 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GscQ02591 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GscQ02591 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GscQ02591 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GscQ02591 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GscQ02591 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GscQ02591 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GscQ02591 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GscQ02591 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GscQ02591 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GscQ02591 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GscQ02591 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GscQ02591 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GscQ02591 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GscQ02591 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GscQ02591 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GscQ02591 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GscQ02591 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms