Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htr1fQ02284 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htr1fQ02284 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htr1fQ02284 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htr1fQ02284 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htr1fQ02284 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htr1fQ02284 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htr1fQ02284 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Htr1fQ02284 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htr1fQ02284 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htr1fQ02284 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htr1fQ02284 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htr1fQ02284 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htr1fQ02284 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Htr1fQ02284 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr1fQ02284 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr1fQ02284 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr1fQ02284 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr1fQ02284 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr1fQ02284 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr1fQ02284 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr1fQ02284 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htr1fQ02284 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr1fQ02284 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr1fQ02284 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htr1fQ02284 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htr1fQ02284 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr1fQ02284 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr1fQ02284 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr1fQ02284 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr1fQ02284 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr1fQ02284 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr1fQ02284 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr1fQ02284 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htr1fQ02284 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htr1fQ02284 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htr1fQ02284 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Htr1fQ02284 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Htr1fQ02284 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr1fQ02284 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr1fQ02284 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr1fQ02284 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr1fQ02284 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr1fQ02284 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr1fQ02284 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr1fQ02284 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htr1fQ02284 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Htr1fQ02284 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Htr1fQ02284 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Htr1fQ02284 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Htr1fQ02284 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Htr1fQ02284 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Htr1fQ02284 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Htr1fQ02284 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Htr1fQ02284 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Htr1fQ02284 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Htr1fQ02284 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Htr1fQ02284 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Htr1fQ02284 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Htr1fQ02284 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms