Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pde1bQ01065 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pde1bQ01065 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde1bQ01065 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde1bQ01065 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde1bQ01065 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde1bQ01065 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde1bQ01065 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde1bQ01065 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde1bQ01065 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pde1bQ01065 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pde1bQ01065 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde1bQ01065 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde1bQ01065 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde1bQ01065 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde1bQ01065 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde1bQ01065 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde1bQ01065 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde1bQ01065 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pde1bQ01065 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pde1bQ01065 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pde1bQ01065 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde1bQ01065 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde1bQ01065 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde1bQ01065 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde1bQ01065 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde1bQ01065 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde1bQ01065 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde1bQ01065 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde1bQ01065 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde1bQ01065 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde1bQ01065 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde1bQ01065 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde1bQ01065 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde1bQ01065 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde1bQ01065 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde1bQ01065 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde1bQ01065 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde1bQ01065 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde1bQ01065 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde1bQ01065 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde1bQ01065 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde1bQ01065 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde1bQ01065 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde1bQ01065 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde1bQ01065 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde1bQ01065 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde1bQ01065 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde1bQ01065 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pde1bQ01065 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde1bQ01065 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde1bQ01065 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde1bQ01065 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde1bQ01065 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pde1bQ01065 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde1bQ01065 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde1bQ01065 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde1bQ01065 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde1bQ01065 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde1bQ01065 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde1bQ01065 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde1bQ01065 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde1bQ01065 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde1bQ01065 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde1bQ01065 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde1bQ01065 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde1bQ01065 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde1bQ01065 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde1bQ01065 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde1bQ01065 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde1bQ01065 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde1bQ01065 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde1bQ01065 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde1bQ01065 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde1bQ01065 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde1bQ01065 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms