Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbp4Q00724 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbp4Q00724 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbp4Q00724 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbp4Q00724 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rbp4Q00724 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbp4Q00724 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbp4Q00724 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbp4Q00724 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbp4Q00724 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbp4Q00724 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbp4Q00724 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbp4Q00724 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbp4Q00724 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp4Q00724 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp4Q00724 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp4Q00724 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp4Q00724 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp4Q00724 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp4Q00724 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp4Q00724 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp4Q00724 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp4Q00724 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp4Q00724 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp4Q00724 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp4Q00724 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp4Q00724 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp4Q00724 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp4Q00724 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp4Q00724 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbp4Q00724 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbp4Q00724 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbp4Q00724 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbp4Q00724 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbp4Q00724 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbp4Q00724 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbp4Q00724 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbp4Q00724 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp4Q00724 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp4Q00724 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp4Q00724 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp4Q00724 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp4Q00724 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbp4Q00724 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbp4Q00724 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbp4Q00724 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbp4Q00724 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbp4Q00724 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp4Q00724 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms