Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gabpb1Q00420 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gabpb1Q00420 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gabpb1Q00420 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gabpb1Q00420 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gabpb1Q00420 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gabpb1Q00420 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gabpb1Q00420 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gabpb1Q00420 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gabpb1Q00420 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gabpb1Q00420 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gabpb1Q00420 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gabpb1Q00420 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gabpb1Q00420 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gabpb1Q00420 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gabpb1Q00420 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gabpb1Q00420 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gabpb1Q00420 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gabpb1Q00420 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gabpb1Q00420 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gabpb1Q00420 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gabpb1Q00420 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gabpb1Q00420 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gabpb1Q00420 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gabpb1Q00420 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gabpb1Q00420 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gabpb1Q00420 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gabpb1Q00420 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gabpb1Q00420 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gabpb1Q00420 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gabpb1Q00420 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gabpb1Q00420 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gabpb1Q00420 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gabpb1Q00420 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gabpb1Q00420 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gabpb1Q00420 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gabpb1Q00420 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabpb1Q00420 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gabpb1Q00420 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Gabpb1Q00420 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabpb1Q00420 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabpb1Q00420 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabpb1Q00420 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gabpb1Q00420 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gabpb1Q00420 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gabpb1Q00420 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gabpb1Q00420 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gabpb1Q00420 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gabpb1Q00420 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabpb1Q00420 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabpb1Q00420 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gabpb1Q00420 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gabpb1Q00420 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gabpb1Q00420 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gabpb1Q00420 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gabpb1Q00420 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gabpb1Q00420 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gabpb1Q00420 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gabpb1Q00420 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gabpb1Q00420 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gabpb1Q00420 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gabpb1Q00420 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gabpb1Q00420 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gabpb1Q00420 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gabpb1Q00420 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gabpb1Q00420 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gabpb1Q00420 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gabpb1Q00420 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gabpb1Q00420 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gabpb1Q00420 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gabpb1Q00420 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gabpb1Q00420 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gabpb1Q00420 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gabpb1Q00420 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gabpb1Q00420 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gabpb1Q00420 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gabpb1Q00420 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gabpb1Q00420 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gabpb1Q00420 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gabpb1Q00420 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabpb1Q00420 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabpb1Q00420 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabpb1Q00420 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabpb1Q00420 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gabpb1Q00420 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms