Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp10Q000W5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp10Q000W5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp10Q000W5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp10Q000W5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp10Q000W5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp10Q000W5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp10Q000W5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp10Q000W5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp10Q000W5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp10Q000W5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp10Q000W5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp10Q000W5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gbp10Q000W5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gbp10Q000W5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp10Q000W5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp10Q000W5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp10Q000W5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp10Q000W5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp10Q000W5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp10Q000W5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp10Q000W5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp10Q000W5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp10Q000W5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp10Q000W5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp10Q000W5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp10Q000W5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp10Q000W5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp10Q000W5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp10Q000W5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp10Q000W5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp10Q000W5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp10Q000W5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp10Q000W5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp10Q000W5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp10Q000W5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp10Q000W5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp10Q000W5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp10Q000W5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp10Q000W5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp10Q000W5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp10Q000W5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp10Q000W5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gbp10Q000W5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp10Q000W5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp10Q000W5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp10Q000W5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp10Q000W5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp10Q000W5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp10Q000W5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp10Q000W5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp10Q000W5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp10Q000W5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp10Q000W5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp10Q000W5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp10Q000W5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp10Q000W5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gbp10Q000W5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp10Q000W5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gbp10Q000W5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gbp10Q000W5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp10Q000W5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp10Q000W5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp10Q000W5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp10Q000W5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp10Q000W5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp10Q000W5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms