Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2cP97760 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2cP97760 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2cP97760 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2cP97760 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr2cP97760 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr2cP97760 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2cP97760 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2cP97760 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2cP97760 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2cP97760 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2cP97760 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2cP97760 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2cP97760 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2cP97760 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2cP97760 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2cP97760 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2cP97760 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2cP97760 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Polr2cP97760 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr2cP97760 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2cP97760 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr2cP97760 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr2cP97760 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2cP97760 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2cP97760 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2cP97760 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2cP97760 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2cP97760 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr2cP97760 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr2cP97760 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr2cP97760 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr2cP97760 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr2cP97760 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr2cP97760 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr2cP97760 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2cP97760 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2cP97760 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2cP97760 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2cP97760 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr2cP97760 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr2cP97760 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr2cP97760 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2cP97760 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2cP97760 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2cP97760 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2cP97760 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2cP97760 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr2cP97760 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2cP97760 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2cP97760 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr2cP97760 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2cP97760 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2cP97760 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2cP97760 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2cP97760 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2cP97760 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2cP97760 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2cP97760 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2cP97760 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2cP97760 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr2cP97760 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr2cP97760 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2cP97760 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2cP97760 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2cP97760 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr2cP97760 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2cP97760 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2cP97760 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2cP97760 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2cP97760 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2cP97760 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2cP97760 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2cP97760 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2cP97760 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2cP97760 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2cP97760 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2cP97760 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms