Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gata5P97489 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gata5P97489 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gata5P97489 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gata5P97489 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gata5P97489 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gata5P97489 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gata5P97489 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gata5P97489 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gata5P97489 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gata5P97489 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gata5P97489 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gata5P97489 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gata5P97489 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gata5P97489 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gata5P97489 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gata5P97489 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gata5P97489 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gata5P97489 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gata5P97489 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gata5P97489 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gata5P97489 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gata5P97489 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gata5P97489 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gata5P97489 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gata5P97489 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gata5P97489 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gata5P97489 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gata5P97489 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gata5P97489 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gata5P97489 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gata5P97489 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gata5P97489 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gata5P97489 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gata5P97489 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gata5P97489 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gata5P97489 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gata5P97489 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gata5P97489 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gata5P97489 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gata5P97489 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gata5P97489 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gata5P97489 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gata5P97489 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gata5P97489 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gata5P97489 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gata5P97489 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gata5P97489 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gata5P97489 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gata5P97489 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gata5P97489 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gata5P97489 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gata5P97489 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gata5P97489 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gata5P97489 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gata5P97489 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gata5P97489 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gata5P97489 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gata5P97489 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gata5P97489 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gata5P97489 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gata5P97489 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gata5P97489 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gata5P97489 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gata5P97489 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gata5P97489 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gata5P97489 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gata5P97489 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gata5P97489 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gata5P97489 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gata5P97489 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gata5P97489 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gata5P97489 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gata5P97489 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gata5P97489 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gata5P97489 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gata5P97489 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gata5P97489 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gata5P97489 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gata5P97489 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gata5P97489 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gata5P97489 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gata5P97489 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gata5P97489 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms