Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smad4P97471 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smad4P97471 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smad4P97471 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smad4P97471 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smad4P97471 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Smad4P97471 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smad4P97471 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smad4P97471 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smad4P97471 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smad4P97471 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smad4P97471 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smad4P97471 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smad4P97471 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smad4P97471 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smad4P97471 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smad4P97471 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smad4P97471 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smad4P97471 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smad4P97471 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Smad4P97471 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smad4P97471 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smad4P97471 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smad4P97471 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smad4P97471 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smad4P97471 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smad4P97471 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smad4P97471 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smad4P97471 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smad4P97471 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smad4P97471 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smad4P97471 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smad4P97471 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smad4P97471 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smad4P97471 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smad4P97471 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smad4P97471 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smad4P97471 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smad4P97471 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smad4P97471 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smad4P97471 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smad4P97471 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smad4P97471 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smad4P97471 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smad4P97471 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smad4P97471 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smad4P97471 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smad4P97471 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smad4P97471 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smad4P97471 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smad4P97471 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smad4P97471 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smad4P97471 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smad4P97471 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smad4P97471 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smad4P97471 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smad4P97471 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smad4P97471 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smad4P97471 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smad4P97471 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smad4P97471 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smad4P97471 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smad4P97471 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smad4P97471 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smad4P97471 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smad4P97471 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smad4P97471 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smad4P97471 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smad4P97471 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smad4P97471 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smad4P97471 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smad4P97471 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smad4P97471 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smad4P97471 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smad4P97471 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smad4P97471 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smad4P97471 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smad4P97471 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smad4P97471 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smad4P97471 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smad4P97471 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smad4P97471 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smad4P97471 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smad4P97471 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smad4P97471 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smad4P97471 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smad4P97471 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smad4P97471 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad4P97471 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad4P97471 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad4P97471 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad4P97471 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad4P97471 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad4P97471 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad4P97471 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smad4P97471 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smad4P97471 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smad4P97471 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smad4P97471 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smad4P97471 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms