Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmklr1P97468 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmklr1P97468 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmklr1P97468 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmklr1P97468 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmklr1P97468 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmklr1P97468 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmklr1P97468 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmklr1P97468 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmklr1P97468 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmklr1P97468 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmklr1P97468 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmklr1P97468 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmklr1P97468 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cmklr1P97468 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmklr1P97468 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmklr1P97468 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmklr1P97468 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmklr1P97468 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmklr1P97468 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmklr1P97468 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmklr1P97468 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmklr1P97468 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmklr1P97468 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmklr1P97468 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmklr1P97468 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cmklr1P97468 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cmklr1P97468 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cmklr1P97468 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cmklr1P97468 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cmklr1P97468 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmklr1P97468 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmklr1P97468 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmklr1P97468 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmklr1P97468 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmklr1P97468 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmklr1P97468 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmklr1P97468 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmklr1P97468 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmklr1P97468 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmklr1P97468 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmklr1P97468 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmklr1P97468 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmklr1P97468 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmklr1P97468 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmklr1P97468 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmklr1P97468 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmklr1P97468 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmklr1P97468 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmklr1P97468 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmklr1P97468 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmklr1P97468 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmklr1P97468 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmklr1P97468 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmklr1P97468 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmklr1P97468 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmklr1P97468 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmklr1P97468 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmklr1P97468 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmklr1P97468 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmklr1P97468 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmklr1P97468 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmklr1P97468 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmklr1P97468 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmklr1P97468 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmklr1P97468 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms