Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npas2P97460 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npas2P97460 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npas2P97460 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npas2P97460 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npas2P97460 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Npas2P97460 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npas2P97460 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npas2P97460 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npas2P97460 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npas2P97460 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npas2P97460 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npas2P97460 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npas2P97460 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npas2P97460 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npas2P97460 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npas2P97460 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npas2P97460 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npas2P97460 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npas2P97460 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npas2P97460 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npas2P97460 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npas2P97460 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npas2P97460 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npas2P97460 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npas2P97460 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npas2P97460 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npas2P97460 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npas2P97460 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Npas2P97460 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npas2P97460 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npas2P97460 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npas2P97460 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npas2P97460 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npas2P97460 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npas2P97460 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npas2P97460 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npas2P97460 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npas2P97460 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npas2P97460 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npas2P97460 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Npas2P97460 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Npas2P97460 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Npas2P97460 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Npas2P97460 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Npas2P97460 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Npas2P97460 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Npas2P97460 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Npas2P97460 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Npas2P97460 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Npas2P97460 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npas2P97460 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npas2P97460 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npas2P97460 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npas2P97460 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npas2P97460 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npas2P97460 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Npas2P97460 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Npas2P97460 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Npas2P97460 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npas2P97460 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npas2P97460 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npas2P97460 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npas2P97460 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npas2P97460 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npas2P97460 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npas2P97460 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Npas2P97460 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Npas2P97460 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Npas2P97460 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Npas2P97460 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Npas2P97460 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Npas2P97460 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Npas2P97460 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Npas2P97460 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Npas2P97460 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Npas2P97460 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Npas2P97460 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Npas2P97460 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Npas2P97460 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Npas2P97460 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms