Protein–RNA interactions for Protein: P97440

Slbp, Histone RNA hairpin-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlbpP97440 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
SlbpP97440 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SlbpP97440 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SlbpP97440 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlbpP97440 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlbpP97440 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlbpP97440 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlbpP97440 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlbpP97440 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlbpP97440 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SlbpP97440 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SlbpP97440 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlbpP97440 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlbpP97440 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SlbpP97440 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlbpP97440 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms