Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hist1h3bP84228 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hist1h3bP84228 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hist1h3bP84228 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hist1h3bP84228 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hist1h3bP84228 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hist1h3bP84228 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hist1h3bP84228 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hist1h3bP84228 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hist1h3bP84228 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hist1h3bP84228 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hist1h3bP84228 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hist1h3bP84228 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hist1h3bP84228 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hist1h3bP84228 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hist1h3bP84228 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hist1h3bP84228 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hist1h3bP84228 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hist1h3bP84228 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hist1h3bP84228 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hist1h3bP84228 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hist1h3bP84228 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hist1h3bP84228 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hist1h3bP84228 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hist1h3bP84228 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist1h3bP84228 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist1h3bP84228 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist1h3bP84228 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hist1h3bP84228 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hist1h3bP84228 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hist1h3bP84228 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hist1h3bP84228 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hist1h3bP84228 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hist1h3bP84228 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hist1h3bP84228 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hist1h3bP84228 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hist1h3bP84228 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hist1h3bP84228 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hist1h3bP84228 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hist1h3bP84228 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hist1h3bP84228 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hist1h3bP84228 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hist1h3bP84228 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hist1h3bP84228 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hist1h3bP84228 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hist1h3bP84228 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms