Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubg1P83887 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubg1P83887 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubg1P83887 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubg1P83887 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubg1P83887 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubg1P83887 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubg1P83887 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubg1P83887 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubg1P83887 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubg1P83887 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubg1P83887 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubg1P83887 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubg1P83887 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubg1P83887 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubg1P83887 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubg1P83887 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubg1P83887 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubg1P83887 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubg1P83887 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubg1P83887 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubg1P83887 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubg1P83887 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubg1P83887 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tubg1P83887 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubg1P83887 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubg1P83887 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubg1P83887 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubg1P83887 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubg1P83887 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubg1P83887 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubg1P83887 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubg1P83887 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubg1P83887 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubg1P83887 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubg1P83887 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubg1P83887 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubg1P83887 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubg1P83887 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubg1P83887 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubg1P83887 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubg1P83887 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubg1P83887 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubg1P83887 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubg1P83887 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubg1P83887 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubg1P83887 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubg1P83887 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubg1P83887 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubg1P83887 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubg1P83887 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms