Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gabpb2P81069 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gabpb2P81069 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gabpb2P81069 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gabpb2P81069 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gabpb2P81069 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gabpb2P81069 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gabpb2P81069 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Gabpb2P81069 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gabpb2P81069 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gabpb2P81069 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gabpb2P81069 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gabpb2P81069 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gabpb2P81069 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gabpb2P81069 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gabpb2P81069 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gabpb2P81069 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gabpb2P81069 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gabpb2P81069 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gabpb2P81069 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gabpb2P81069 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gabpb2P81069 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gabpb2P81069 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gabpb2P81069 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gabpb2P81069 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Gabpb2P81069 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gabpb2P81069 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gabpb2P81069 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gabpb2P81069 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gabpb2P81069 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gabpb2P81069 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gabpb2P81069 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gabpb2P81069 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gabpb2P81069 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gabpb2P81069 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gabpb2P81069 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gabpb2P81069 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gabpb2P81069 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gabpb2P81069 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gabpb2P81069 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gabpb2P81069 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gabpb2P81069 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Gabpb2P81069 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gabpb2P81069 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gabpb2P81069 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gabpb2P81069 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gabpb2P81069 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gabpb2P81069 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gabpb2P81069 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gabpb2P81069 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gabpb2P81069 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gabpb2P81069 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gabpb2P81069 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gabpb2P81069 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gabpb2P81069 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gabpb2P81069 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gabpb2P81069 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gabpb2P81069 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gabpb2P81069 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gabpb2P81069 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gabpb2P81069 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gabpb2P81069 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gabpb2P81069 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gabpb2P81069 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gabpb2P81069 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gabpb2P81069 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gabpb2P81069 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gabpb2P81069 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gabpb2P81069 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gabpb2P81069 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gabpb2P81069 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gabpb2P81069 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms