Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Rad50P70388 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rad50P70388 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rad50P70388 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rad50P70388 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rad50P70388 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rad50P70388 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rad50P70388 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rad50P70388 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rad50P70388 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rad50P70388 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rad50P70388 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rad50P70388 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rad50P70388 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rad50P70388 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rad50P70388 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rad50P70388 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rad50P70388 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rad50P70388 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rad50P70388 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rad50P70388 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rad50P70388 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rad50P70388 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rad50P70388 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rad50P70388 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rad50P70388 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rad50P70388 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rad50P70388 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rad50P70388 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rad50P70388 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rad50P70388 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rad50P70388 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rad50P70388 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rad50P70388 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rad50P70388 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rad50P70388 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Rad50P70388 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rad50P70388 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad50P70388 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad50P70388 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad50P70388 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad50P70388 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rad50P70388 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rad50P70388 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rad50P70388 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Rad50P70388 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad50P70388 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rad50P70388 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad50P70388 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rad50P70388 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rad50P70388 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rad50P70388 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rad50P70388 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rad50P70388 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rad50P70388 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rad50P70388 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rad50P70388 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rad50P70388 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rad50P70388 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rad50P70388 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rad50P70388 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rad50P70388 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rad50P70388 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rad50P70388 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rad50P70388 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rad50P70388 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Rad50P70388 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rad50P70388 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rad50P70388 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rad50P70388 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rad50P70388 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rad50P70388 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rad50P70388 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rad50P70388 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rad50P70388 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rad50P70388 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rad50P70388 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rad50P70388 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rad50P70388 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rad50P70388 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rad50P70388 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rad50P70388 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rad50P70388 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rad50P70388 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rad50P70388 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms