Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig1P70193 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrig1P70193 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrig1P70193 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrig1P70193 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrig1P70193 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrig1P70193 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrig1P70193 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrig1P70193 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrig1P70193 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrig1P70193 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrig1P70193 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrig1P70193 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrig1P70193 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrig1P70193 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrig1P70193 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrig1P70193 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrig1P70193 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrig1P70193 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrig1P70193 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrig1P70193 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrig1P70193 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrig1P70193 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrig1P70193 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrig1P70193 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrig1P70193 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrig1P70193 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrig1P70193 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrig1P70193 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrig1P70193 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrig1P70193 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrig1P70193 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrig1P70193 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrig1P70193 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrig1P70193 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrig1P70193 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrig1P70193 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrig1P70193 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrig1P70193 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrig1P70193 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrig1P70193 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrig1P70193 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrig1P70193 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrig1P70193 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrig1P70193 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrig1P70193 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrig1P70193 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrig1P70193 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrig1P70193 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrig1P70193 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrig1P70193 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrig1P70193 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrig1P70193 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrig1P70193 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrig1P70193 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrig1P70193 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrig1P70193 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrig1P70193 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrig1P70193 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrig1P70193 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrig1P70193 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrig1P70193 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrig1P70193 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrig1P70193 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrig1P70193 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrig1P70193 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrig1P70193 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrig1P70193 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrig1P70193 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms