Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tuba4aP68368 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tuba4aP68368 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tuba4aP68368 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tuba4aP68368 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba4aP68368 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba4aP68368 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tuba4aP68368 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tuba4aP68368 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tuba4aP68368 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tuba4aP68368 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tuba4aP68368 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tuba4aP68368 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tuba4aP68368 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tuba4aP68368 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tuba4aP68368 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tuba4aP68368 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tuba4aP68368 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tuba4aP68368 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tuba4aP68368 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tuba4aP68368 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tuba4aP68368 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tuba4aP68368 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tuba4aP68368 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tuba4aP68368 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tuba4aP68368 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tuba4aP68368 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tuba4aP68368 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tuba4aP68368 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tuba4aP68368 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tuba4aP68368 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tuba4aP68368 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tuba4aP68368 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tuba4aP68368 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tuba4aP68368 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tuba4aP68368 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tuba4aP68368 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tuba4aP68368 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tuba4aP68368 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tuba4aP68368 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tuba4aP68368 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tuba4aP68368 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tuba4aP68368 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tuba4aP68368 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tuba4aP68368 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tuba4aP68368 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tuba4aP68368 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tuba4aP68368 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tuba4aP68368 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tuba4aP68368 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tuba4aP68368 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tuba4aP68368 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tuba4aP68368 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tuba4aP68368 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tuba4aP68368 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tuba4aP68368 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tuba4aP68368 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tuba4aP68368 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tuba4aP68368 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tuba4aP68368 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tuba4aP68368 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tuba4aP68368 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tuba4aP68368 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tuba4aP68368 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tuba4aP68368 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms