Protein–RNA interactions for Protein: P63040

Cplx1, Complexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx1P63040 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cplx1P63040 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Cplx1P63040 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Cplx1P63040 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cplx1P63040 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cplx1P63040 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cplx1P63040 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Cplx1P63040 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Cplx1P63040 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Cplx1P63040 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Cplx1P63040 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Cplx1P63040 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Cplx1P63040 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Cplx1P63040 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Cplx1P63040 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Cplx1P63040 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Cplx1P63040 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Cplx1P63040 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Cplx1P63040 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Cplx1P63040 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Cplx1P63040 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Cplx1P63040 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Cplx1P63040 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Cplx1P63040 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Cplx1P63040 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Cplx1P63040 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Cplx1P63040 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Cplx1P63040 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Cplx1P63040 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Cplx1P63040 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Cplx1P63040 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cplx1P63040 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cplx1P63040 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cplx1P63040 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cplx1P63040 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cplx1P63040 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cplx1P63040 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Cplx1P63040 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Cplx1P63040 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Cplx1P63040 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Cplx1P63040 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Cplx1P63040 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Cplx1P63040 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Cplx1P63040 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Cplx1P63040 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Cplx1P63040 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Cplx1P63040 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Cplx1P63040 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Cplx1P63040 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Cplx1P63040 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Cplx1P63040 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Cplx1P63040 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Cplx1P63040 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Cplx1P63040 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Cplx1P63040 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Cplx1P63040 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Cplx1P63040 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Cplx1P63040 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Cplx1P63040 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Cplx1P63040 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Cplx1P63040 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Cplx1P63040 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Cplx1P63040 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Cplx1P63040 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Cplx1P63040 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Cplx1P63040 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Cplx1P63040 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Cplx1P63040 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Cplx1P63040 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Cplx1P63040 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Cplx1P63040 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cplx1P63040 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Cplx1P63040 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cplx1P63040 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cplx1P63040 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cplx1P63040 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cplx1P63040 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Cplx1P63040 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Cplx1P63040 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Cplx1P63040 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cplx1P63040 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Cplx1P63040 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Cplx1P63040 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cplx1P63040 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Cplx1P63040 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Cplx1P63040 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Cplx1P63040 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Cplx1P63040 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Cplx1P63040 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Cplx1P63040 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Cplx1P63040 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cplx1P63040 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cplx1P63040 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cplx1P63040 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cplx1P63040 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cplx1P63040 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cplx1P63040 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cplx1P63040 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Cplx1P63040 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cplx1P63040 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,5 ms