Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp3P63024 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp3P63024 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp3P63024 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp3P63024 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp3P63024 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp3P63024 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp3P63024 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp3P63024 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp3P63024 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp3P63024 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp3P63024 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp3P63024 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp3P63024 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp3P63024 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp3P63024 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp3P63024 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp3P63024 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp3P63024 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp3P63024 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp3P63024 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp3P63024 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp3P63024 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp3P63024 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp3P63024 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp3P63024 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp3P63024 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp3P63024 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp3P63024 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp3P63024 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vamp3P63024 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp3P63024 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp3P63024 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp3P63024 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp3P63024 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp3P63024 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp3P63024 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp3P63024 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp3P63024 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp3P63024 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp3P63024 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp3P63024 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp3P63024 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms