Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacng7P62956 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng7P62956 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng7P62956 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng7P62956 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacng7P62956 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacng7P62956 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacng7P62956 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng7P62956 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng7P62956 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng7P62956 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng7P62956 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng7P62956 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms