Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl23P62830 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl23P62830 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl23P62830 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl23P62830 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl23P62830 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl23P62830 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl23P62830 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl23P62830 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl23P62830 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl23P62830 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl23P62830 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl23P62830 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl23P62830 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl23P62830 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl23P62830 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl23P62830 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl23P62830 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl23P62830 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl23P62830 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpl23P62830 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpl23P62830 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl23P62830 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl23P62830 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl23P62830 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms