Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acta2P62737 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acta2P62737 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acta2P62737 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Acta2P62737 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acta2P62737 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acta2P62737 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acta2P62737 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acta2P62737 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acta2P62737 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acta2P62737 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acta2P62737 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acta2P62737 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acta2P62737 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acta2P62737 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acta2P62737 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acta2P62737 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Acta2P62737 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acta2P62737 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acta2P62737 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acta2P62737 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Acta2P62737 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acta2P62737 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acta2P62737 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Acta2P62737 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Acta2P62737 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acta2P62737 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acta2P62737 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Acta2P62737 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acta2P62737 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acta2P62737 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acta2P62737 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Acta2P62737 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Acta2P62737 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Acta2P62737 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acta2P62737 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acta2P62737 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acta2P62737 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acta2P62737 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acta2P62737 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Acta2P62737 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Acta2P62737 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acta2P62737 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acta2P62737 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acta2P62737 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acta2P62737 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acta2P62737 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acta2P62737 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acta2P62737 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acta2P62737 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acta2P62737 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acta2P62737 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acta2P62737 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acta2P62737 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acta2P62737 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acta2P62737 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acta2P62737 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acta2P62737 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acta2P62737 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acta2P62737 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acta2P62737 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acta2P62737 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acta2P62737 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Acta2P62737 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Acta2P62737 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Acta2P62737 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Acta2P62737 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Acta2P62737 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Acta2P62737 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Acta2P62737 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Acta2P62737 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Acta2P62737 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Acta2P62737 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acta2P62737 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Acta2P62737 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Acta2P62737 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Acta2P62737 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acta2P62737 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acta2P62737 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Acta2P62737 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Acta2P62737 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms