Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl18aP62717 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl18aP62717 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl18aP62717 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl18aP62717 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl18aP62717 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms