Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snrpd3P62320 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd3P62320 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd3P62320 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd3P62320 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd3P62320 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd3P62320 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd3P62320 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd3P62320 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd3P62320 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd3P62320 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd3P62320 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd3P62320 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd3P62320 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snrpd3P62320 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snrpd3P62320 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snrpd3P62320 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpd3P62320 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd3P62320 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snrpd3P62320 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snrpd3P62320 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd3P62320 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms