Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Lrch1P62046 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Lrch1P62046 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30,28■■■□□ 2,44
Lrch1P62046 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Lrch1P62046 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Lrch1P62046 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Lrch1P62046 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Lrch1P62046 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Lrch1P62046 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Lrch1P62046 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Lrch1P62046 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Lrch1P62046 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Lrch1P62046 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Lrch1P62046 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Lrch1P62046 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Lrch1P62046 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30,2■■■□□ 2,43
Lrch1P62046 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Lrch1P62046 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Lrch1P62046 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Lrch1P62046 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Lrch1P62046 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Lrch1P62046 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Lrch1P62046 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Lrch1P62046 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Lrch1P62046 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Lrch1P62046 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Lrch1P62046 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Lrch1P62046 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Lrch1P62046 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Lrch1P62046 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Lrch1P62046 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Lrch1P62046 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Lrch1P62046 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Lrch1P62046 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Lrch1P62046 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Lrch1P62046 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Lrch1P62046 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Lrch1P62046 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Lrch1P62046 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Lrch1P62046 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Lrch1P62046 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Lrch1P62046 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Lrch1P62046 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Lrch1P62046 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Lrch1P62046 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Lrch1P62046 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Lrch1P62046 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Lrch1P62046 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Lrch1P62046 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Lrch1P62046 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Lrch1P62046 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Lrch1P62046 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Lrch1P62046 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Lrch1P62046 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Lrch1P62046 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Lrch1P62046 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Lrch1P62046 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Lrch1P62046 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Lrch1P62046 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
Lrch1P62046 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Lrch1P62046 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Lrch1P62046 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Lrch1P62046 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Lrch1P62046 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Lrch1P62046 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Lrch1P62046 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Lrch1P62046 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Lrch1P62046 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Lrch1P62046 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Lrch1P62046 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Lrch1P62046 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Lrch1P62046 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Lrch1P62046 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
Lrch1P62046 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Lrch1P62046 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Lrch1P62046 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Lrch1P62046 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Lrch1P62046 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Lrch1P62046 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Lrch1P62046 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Lrch1P62046 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Lrch1P62046 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Lrch1P62046 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Lrch1P62046 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Lrch1P62046 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Lrch1P62046 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Lrch1P62046 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Lrch1P62046 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Lrch1P62046 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Lrch1P62046 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Lrch1P62046 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Lrch1P62046 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Lrch1P62046 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Lrch1P62046 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Lrch1P62046 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Lrch1P62046 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Lrch1P62046 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Lrch1P62046 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Lrch1P62046 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Lrch1P62046 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,3 ms